Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C19P33261 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms