Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms