Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms