Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms