Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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