Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2P22307 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2P22307 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCP2P22307 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCP2P22307 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms