Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MSR1P21757 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSR1P21757 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSR1P21757 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSR1P21757 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSR1P21757 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms