Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1P21675 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1P21675 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF1P21675 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1P21675 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1P21675 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1P21675 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1P21675 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1P21675 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1P21675 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1P21675 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1P21675 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1P21675 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1P21675 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1P21675 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms