Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms