Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNB1P20700 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNB1P20700 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms