Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms