Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCLP19338 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCLP19338 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCLP19338 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NCLP19338 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCLP19338 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCLP19338 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCLP19338 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCLP19338 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.9 ms