Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHCEP18577 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHCEP18577 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms