Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms