Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms