Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB3P14651 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms