Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM27P14373 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM27P14373 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms