Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP3P12645 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP3P12645 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BMP3P12645 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms