Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms