Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CETPP11597 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CETPP11597 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CETPP11597 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CETPP11597 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CETPP11597 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CETPP11597 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CETPP11597 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CETPP11597 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CETPP11597 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms