Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2BP0DI82 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms