Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSF1P09603 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSF1P09603 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSF1P09603 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms