Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSMBP08118 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms