Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOP08100 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOP08100 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOP08100 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOP08100 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms