Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEFMP07197 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFMP07197 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms