Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAVP06756 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms