Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms