Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYCNP04198 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYCNP04198 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms