Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms