Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24BO95487 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms