Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFL1O94874 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFL1O94874 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFL1O94874 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFL1O94874 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFL1O94874 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms