Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRPM2O94759 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM2O94759 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms