Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEBLO76041 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEBLO76041 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEBLO76041 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms