Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3JO75822 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms