Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NPHP4O75161 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NPHP4O75161 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms