Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms