Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNT1O60563 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms