Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms