Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB3O43889 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB3O43889 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB3O43889 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms