Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCO2O43819 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCO2O43819 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCO2O43819 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms