Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBFA2T2O43439 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms