Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHHO43323 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHHO43323 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHHO43323 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHHO43323 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHHO43323 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHHO43323 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHHO43323 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms