Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRGAP3O43295 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms