Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms