Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms