Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EBAG9O00559 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms