Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIP1O00291 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIP1O00291 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIP1O00291 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIP1O00291 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIP1O00291 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIP1O00291 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIP1O00291 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms