Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
J3KT08 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
J3KT08 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
J3KT08 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
J3KT08 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms