Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BQV1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BQV1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BQV1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BQV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BQV1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms