Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf172C9J069 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf172C9J069 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms